138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1841 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  100 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  63.68 
 
 
223 aa  291  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  60.44 
 
 
224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  50.44 
 
 
241 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  48.67 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  49.33 
 
 
247 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  50 
 
 
230 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  45.89 
 
 
237 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  33.77 
 
 
250 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32.6 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  29.61 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  32.08 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.9 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.05 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  30.54 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  33.1 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  28.27 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  32.62 
 
 
219 aa  62  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  26.36 
 
 
254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  27 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  27.66 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  25 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.29 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  27.54 
 
 
251 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.78 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  32.72 
 
 
253 aa  58.2  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  26.84 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  33.95 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  27.62 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  35.77 
 
 
334 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  33.06 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
397 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  28.81 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  28.81 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  28.63 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  28.81 
 
 
255 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  28.63 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  28.63 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  28.63 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
402 aa  55.5  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  26.58 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  26.58 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  33.13 
 
 
248 aa  55.1  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  26.01 
 
 
616 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.58 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  26.78 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  28.72 
 
 
392 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.47 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.16 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  28.15 
 
 
402 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  29.49 
 
 
242 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  33.08 
 
 
249 aa  52  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  32.84 
 
 
254 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.47 
 
 
255 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  25.73 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  26.41 
 
 
246 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  50.88 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  26.87 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  27.2 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  49.12 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  38.37 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  35.48 
 
 
522 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1164  sugar nucleotidyltransferases-like protein  30.32 
 
 
294 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  28.65 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  27.47 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  29.76 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
596 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
397 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
388 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  36.94 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  28.24 
 
 
411 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
325 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  26.92 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.23 
 
 
400 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06761  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.45 
 
 
447 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78468  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
414 aa  45.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  28.43 
 
 
408 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  37.21 
 
 
590 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  26.7 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  32.82 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.55 
 
 
405 aa  45.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.63 
 
 
400 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.24 
 
 
393 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  23.53 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  36.75 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  30.16 
 
 
400 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.52 
 
 
592 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0061  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.95 
 
 
455 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.83 
 
 
393 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>