46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1738 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  500  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  46.39 
 
 
251 aa  218  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  48.54 
 
 
848 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  44.83 
 
 
804 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  39.83 
 
 
1121 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 
1121 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  39.39 
 
 
1121 aa  184  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 
1112 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  36.7 
 
 
703 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  43.6 
 
 
1143 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  41.92 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  42.04 
 
 
247 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  37.11 
 
 
258 aa  158  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  41.36 
 
 
250 aa  154  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  35.16 
 
 
258 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  41.82 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  32 
 
 
1174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  35.57 
 
 
250 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  34.78 
 
 
250 aa  135  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  27.6 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  28.92 
 
 
741 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  28.92 
 
 
741 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  29.76 
 
 
741 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.29 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.85 
 
 
846 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  26.92 
 
 
739 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  26.92 
 
 
739 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  25.35 
 
 
471 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  23.98 
 
 
1310 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  28.07 
 
 
4357 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.09 
 
 
1367 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  25 
 
 
1306 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.71 
 
 
1679 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  23.32 
 
 
313 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.32 
 
 
1013 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.64 
 
 
3507 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  23.53 
 
 
429 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  36.14 
 
 
718 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  23.12 
 
 
4761 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.32 
 
 
4433 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.87 
 
 
864 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1247  Peptidase M23  27.23 
 
 
791 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.51 
 
 
1147 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  26.58 
 
 
1091 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.17 
 
 
11716 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.36 
 
 
754 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>