More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1992 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  750    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  44.53 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  39.63 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  39.37 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  42.82 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  38.02 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  40.78 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  36.33 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.72 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 904 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.4 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.04 
 
 		 404 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.34 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 535 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 360 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.16 
 
 		 935 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  30.86 
 
 		 486 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 575 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.45 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.04 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.44 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.73 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.37 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>