More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0819 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  36.36 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.1 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  27.44 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  29.54 
 
 		 408 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  29.1 
 
 		 415 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  35.2 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  32.86 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  26.42 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  31.44 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  24.78 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  26.51 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  30.7 
 
 		 397 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  27.45 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  26.38 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  29.63 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  29.84 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.17 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  29.21 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  31.41 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  28.71 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  29.28 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.62 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  29.3 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  26.6 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  27.78 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  32.37 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  28.97 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.03 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.24 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  27.09 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.19 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  25.47 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.39 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  29.44 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  27.4 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  27.4 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  27.53 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  24.43 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  28.65 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  25 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  27.05 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  28.02 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.85 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.85 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  25.85 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.85 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  29.59 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  24.78 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  27.46 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  26.57 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  23.98 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.37 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  36.21 
 
 		 876 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  25 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.85 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24.89 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  32.24 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  24.76 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30.09 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  35.83 
 
 		 866 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  25.7 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.09 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  24.15 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  34.43 
 
 		 1010 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  27.32 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  27.09 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  23.68 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.97 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  29.25 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.27 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.85 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  27.81 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.61 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0720  hypothetical protein  24.41 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  26.41 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  26.13 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0126  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.2 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  32.46 
 
 		 506 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  24.64 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  27.72 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  27.93 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.46 
 
 		 402 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  26.7 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.23 
 
 		 326 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  24.15 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  24.15 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  25.41 
 
 		 423 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.66 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  24.15 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  24.15 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>