More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0021 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  100 
 
 		 533 aa  1062    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  50.09 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0923  SMC domain protein  49.36 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.757485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  47.64 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  47.17 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  32.48 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.52 
 
 		 555 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 553 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 573 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 554 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  32.78 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 574 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  31.83 
 
 		 560 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 565 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  31.12 
 
 		 558 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  29.81 
 
 		 572 aa  220  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 573 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  31.44 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.26 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  29.68 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  28.29 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  28.49 
 
 		 559 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  30.84 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  31.48 
 
 		 553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  29.73 
 
 		 572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  31.07 
 
 		 557 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  34.19 
 
 		 547 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  30.66 
 
 		 552 aa  213  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  30.59 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  30.59 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  30.59 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.74 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  30.59 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  32.59 
 
 		 558 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 555 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  31.42 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  27.79 
 
 		 565 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  30.66 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  31.31 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.05 
 
 		 566 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  31.61 
 
 		 573 aa  211  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  27.34 
 
 		 565 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  31.42 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  30.12 
 
 		 552 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  32.52 
 
 		 586 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  31.45 
 
 		 578 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  32.02 
 
 		 553 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  28.67 
 
 		 551 aa  209  9e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  30.05 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  28.78 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  32.16 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  30.89 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 558 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  31.64 
 
 		 556 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  30.25 
 
 		 553 aa  206  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  29.11 
 
 		 569 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 557 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.51 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.51 
 
 		 565 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  31.86 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  31.61 
 
 		 556 aa  204  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  31.58 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  32.16 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  29.43 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  31.68 
 
 		 553 aa  203  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  31.68 
 
 		 553 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 572 aa  203  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  27.08 
 
 		 567 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 559 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  26.96 
 
 		 579 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  31.37 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  33.15 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  32.72 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 553 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  26.57 
 
 		 579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  31.27 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  31.27 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  31.27 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  32.65 
 
 		 523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  31.31 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  31.27 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  30.22 
 
 		 567 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  31.1 
 
 		 553 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  30.3 
 
 		 575 aa  197  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  31.47 
 
 		 553 aa  197  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 557 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  26.39 
 
 		 579 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.99 
 
 		 553 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.99 
 
 		 553 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 555 aa  195  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  28.6 
 
 		 555 aa  196  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>