251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2436 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  167  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0847  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  44.58 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  41.18 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00014  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1122  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  38.55 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  41.1 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>