198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0032 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0032  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.164045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  27.1 
 
 
253 aa  58.5  8e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  26.64 
 
 
253 aa  57.8  1e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.03 
 
 
250 aa  56.6  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.46 
 
 
250 aa  56.6  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  3.75322e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.46 
 
 
250 aa  56.6  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.46 
 
 
250 aa  55.8  5e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  7.59261e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.03 
 
 
250 aa  55.8  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.55895e-14 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  26.06 
 
 
233 aa  53.1  4e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0717  ABC transporter related  23.15 
 
 
249 aa  53.1  4e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1799  ABC transporter-related protein  25.6 
 
 
214 aa  53.1  4e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  24.78 
 
 
230 aa  52.4  6e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  25.13 
 
 
249 aa  52.4  6e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3104  ABC transporter related  24.35 
 
 
574 aa  52.4  7e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00494519  hitchhiker  0.000204056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  22.89 
 
 
229 aa  51.6  9e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0368  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  22.17 
 
 
260 aa  51.2  1e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  24.53 
 
 
253 aa  50.8  2e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  23.5 
 
 
272 aa  50.4  2e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  21.39 
 
 
224 aa  50.4  3e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  5.72537e-06 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  21.62 
 
 
224 aa  49.7  4e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  24.76 
 
 
253 aa  49.7  4e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1058  cell division ATP-binding protein FtsE  22.5 
 
 
230 aa  49.7  4e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1445  ABC transporter related  21.6 
 
 
255 aa  49.7  4e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  23.81 
 
 
223 aa  49.3  5e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.78962e-13 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.24 
 
 
250 aa  49.3  5e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  27.04 
 
 
229 aa  48.9  6e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.72 
 
 
510 aa  48.9  6e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  23.04 
 
 
253 aa  48.9  7e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  23.04 
 
 
253 aa  48.9  7e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  23.18 
 
 
307 aa  48.5  8e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  24.24 
 
 
250 aa  48.5  8e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.04293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.24 
 
 
250 aa  48.5  9e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  25.29 
 
 
229 aa  48.5  9e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  25.29 
 
 
229 aa  48.5  9e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.24 
 
 
250 aa  48.5  9e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.24 
 
 
250 aa  48.5  9e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  23.08 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  23.5 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  23.33 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  26.13 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  26.98 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  20.49 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.03 
 
 
250 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  24.48 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  24.88 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.73561e-05 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  29.14 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  23.27 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  24.24 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  23.04 
 
 
237 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  28.85 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  20.1 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  23.83 
 
 
223 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2153  ABC transporter related protein  20.1 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  8.56593e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  24.23 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.06385e-13  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  23.42 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  22.65 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  23 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  26.92 
 
 
369 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.49 
 
 
490 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  21.29 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  26.02 
 
 
344 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  26.67 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  19.38 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  24.1 
 
 
335 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  23.81 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  24.58 
 
 
539 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  25 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  26.69 
 
 
494 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  25.22 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  21.68 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  23.44 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  27.01 
 
 
490 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  23.27 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  23.27 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  25.33 
 
 
217 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1932  cell division ATP-binding protein FtsE  23.33 
 
 
223 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  6.82616e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  21.39 
 
 
240 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  25.54 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  22.27 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.01 
 
 
490 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0759  hypothetical protein  23.49 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  23.27 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3609  cell division ATP-binding protein FtsE  20.65 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  24.6 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  24.68 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  22.27 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  24.42 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.01 
 
 
490 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  25.29 
 
 
691 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.01 
 
 
490 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  22.04 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  20.73 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  22.77 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  25.61 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  26.32 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  21.57 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  25.51 
 
 
344 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  23.38 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  22.87 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  19.23 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>