More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0002 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
462 aa  931  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  55.02 
 
 
459 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.76973e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  54.82 
 
 
459 aa  517  1e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  54.39 
 
 
459 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03504e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.32 
 
 
464 aa  506  1e-142  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  53.51 
 
 
461 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.23644e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  54.55 
 
 
466 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  53.51 
 
 
459 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.07 
 
 
459 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.63 
 
 
459 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.58 
 
 
470 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.36 
 
 
470 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.36 
 
 
470 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  48.58 
 
 
470 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  48.36 
 
 
470 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.14 
 
 
470 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  48.14 
 
 
470 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.14 
 
 
470 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.36 
 
 
470 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.92 
 
 
470 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  48.14 
 
 
470 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  45.95 
 
 
472 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  43.98 
 
 
461 aa  424  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.5 
 
 
469 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.86 
 
 
460 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.93 
 
 
459 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.86 
 
 
460 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.86 
 
 
460 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  48.23 
 
 
457 aa  417  1e-115  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.54 
 
 
460 aa  417  1e-115  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  45.63 
 
 
461 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  48.02 
 
 
462 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.01 
 
 
460 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.54 
 
 
459 aa  407  1e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  45.35 
 
 
457 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  46.39 
 
 
466 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.24 
 
 
457 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  45.41 
 
 
466 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  44.93 
 
 
462 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  44.44 
 
 
460 aa  391  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  49.45 
 
 
461 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.7 
 
 
461 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.08 
 
 
464 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  44.84 
 
 
461 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.32 
 
 
460 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  45.85 
 
 
464 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  47.49 
 
 
462 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  44.64 
 
 
464 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.03 
 
 
460 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  47.81 
 
 
467 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  46.78 
 
 
462 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  46.78 
 
 
462 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  43.12 
 
 
456 aa  375  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.93 
 
 
461 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.51 
 
 
478 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.74 
 
 
469 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  42.01 
 
 
462 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.06 
 
 
473 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.3 
 
 
471 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  45.6 
 
 
483 aa  364  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.36 
 
 
464 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.43 
 
 
459 aa  358  1e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  41.74 
 
 
474 aa  355  7e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  43.24 
 
 
471 aa  355  9e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  43.4 
 
 
474 aa  355  9e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  44.68 
 
 
481 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.69 
 
 
468 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  43.86 
 
 
461 aa  352  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  42.23 
 
 
460 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  43.22 
 
 
461 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  43.22 
 
 
461 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  3.16331e-05 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.91 
 
 
461 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  44 
 
 
455 aa  347  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  44.79 
 
 
458 aa  346  5e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  43.79 
 
 
459 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  38.82 
 
 
461 aa  346  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  45 
 
 
461 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.3 
 
 
470 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.41 
 
 
460 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.91 
 
 
466 aa  339  8e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  39.39 
 
 
460 aa  337  2e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45 
 
 
474 aa  337  2e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  38.91 
 
 
466 aa  337  3e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  44.9 
 
 
461 aa  337  3e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  42.98 
 
 
479 aa  335  8e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.74 
 
 
486 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 
475 aa  333  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.76 
 
 
758 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.96 
 
 
461 aa  333  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  44.74 
 
 
461 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.21 
 
 
457 aa  332  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.43 
 
 
481 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.9 
 
 
483 aa  327  2e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  40.87 
 
 
457 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.58 
 
 
493 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.88 
 
 
485 aa  319  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 
481 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0882  FAD linked oxidase domain protein  42.11 
 
 
473 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.2 
 
 
460 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  38.9 
 
 
509 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>