231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1563 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
421 aa  794    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.33 
 
 
430 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  46.4 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  45.22 
 
 
455 aa  338  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  53.86 
 
 
445 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  53.47 
 
 
424 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  46.47 
 
 
450 aa  323  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.26 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  45.87 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  45.12 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.8 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  45.56 
 
 
456 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  43.33 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.49 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.03 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.24 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.43 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.15 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.53 
 
 
388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.53 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.87 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.87 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.87 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.37 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  50.53 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.53 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.37 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.87 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.53 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.53 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.53 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.87 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.11 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.53 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  47.41 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.11 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.11 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.85 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.15 
 
 
389 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  44.5 
 
 
451 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.03 
 
 
391 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.89 
 
 
389 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  44.6 
 
 
436 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  50.27 
 
 
388 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  49.74 
 
 
399 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  46.55 
 
 
408 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  43.62 
 
 
379 aa  300  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.24 
 
 
395 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.08 
 
 
407 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.45 
 
 
394 aa  298  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  50.8 
 
 
423 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  49.63 
 
 
392 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  45.01 
 
 
406 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  45.43 
 
 
398 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.97 
 
 
390 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  48.19 
 
 
396 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  47.44 
 
 
393 aa  296  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  50.12 
 
 
408 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  47.64 
 
 
425 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.53 
 
 
391 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  44.1 
 
 
452 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.91 
 
 
400 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  49.22 
 
 
391 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  45.64 
 
 
383 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  45.16 
 
 
438 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.34 
 
 
391 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.65 
 
 
392 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  41.29 
 
 
444 aa  291  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  44.95 
 
 
391 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  43.99 
 
 
475 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  44.07 
 
 
424 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.67 
 
 
399 aa  289  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  42.42 
 
 
395 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.12 
 
 
394 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  42.89 
 
 
451 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.12 
 
 
394 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.46 
 
 
399 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.56 
 
 
391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.37 
 
 
394 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  46.7 
 
 
389 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  41.15 
 
 
468 aa  286  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.6 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  43.34 
 
 
453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  44.74 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  45.08 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.49 
 
 
409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  43.1 
 
 
453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.79 
 
 
382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  44.47 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  37.85 
 
 
427 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.14 
 
 
398 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.48 
 
 
382 aa  279  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  38.41 
 
 
435 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  40.33 
 
 
446 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  41.61 
 
 
464 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.27 
 
 
391 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.82 
 
 
397 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  41.29 
 
 
387 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  43.65 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.33 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>