More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1769 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
331 aa  668  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  61.46 
 
 
334 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  58.03 
 
 
330 aa  339  3e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 
329 aa  337  2e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  53.18 
 
 
373 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  50.16 
 
 
323 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  50 
 
 
327 aa  281  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  49.84 
 
 
323 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  51.64 
 
 
337 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  49.53 
 
 
323 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  44.9 
 
 
311 aa  269  6e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.57577e-07  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.93 
 
 
313 aa  245  7e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
317 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
318 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
492 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
498 aa  239  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  42.55 
 
 
338 aa  239  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
468 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  48.15 
 
 
278 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0087  tRNA synthetase class I (E and Q), catalytic domain protein  43.35 
 
 
374 aa  236  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62423e-07 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
472 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.47292e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  45.03 
 
 
319 aa  232  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
535 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
475 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
508 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
478 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
482 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
477 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.58 
 
 
294 aa  221  1e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  40.33 
 
 
518 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
485 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
466 aa  214  1e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
485 aa  214  2e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
490 aa  213  3e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
465 aa  213  4e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
464 aa  213  4e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
465 aa  213  4e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  46.23 
 
 
314 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
504 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1586  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
369 aa  210  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  45.53 
 
 
297 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.56 
 
 
495 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
490 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
494 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.33 
 
 
303 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  3.45941e-06 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
488 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
471 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  40.46 
 
 
546 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  41.31 
 
 
316 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
477 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  45.31 
 
 
298 aa  201  1e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
492 aa  201  2e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
482 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
491 aa  200  2e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.69 
 
 
296 aa  199  4e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.16 
 
 
293 aa  199  4e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.5 
 
 
293 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.5 
 
 
293 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
479 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  41.32 
 
 
311 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
486 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.72 
 
 
299 aa  197  1e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
491 aa  198  1e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
481 aa  197  2e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
489 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
480 aa  196  4e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
480 aa  196  4e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.1 
 
 
310 aa  196  5e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
494 aa  196  5e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.16 
 
 
284 aa  195  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
485 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.2897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
506 aa  194  1e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
881 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
501 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
467 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
477 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
506 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.64542e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
491 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.57278e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  38.64 
 
 
309 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.96 
 
 
314 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
490 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
494 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
492 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  41.56 
 
 
285 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
499 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.20471e-10  hitchhiker  3.82568e-09 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
495 aa  190  3e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
493 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
466 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
496 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
464 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  44.14 
 
 
309 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.16 
 
 
293 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  46.88 
 
 
283 aa  189  6e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
468 aa  189  6e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
495 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
504 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57984  glutamyl-tRNA synthetase, mitochondrial  37.85 
 
 
491 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.604011  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  44.14 
 
 
316 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
493 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
480 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>