289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0747 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  100 
 
 
157 aa  319  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  59.35 
 
 
155 aa  183  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  53.25 
 
 
156 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  53.9 
 
 
155 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  44.08 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  42.11 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  43.79 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  40.79 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  41.83 
 
 
154 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  40.4 
 
 
145 aa  107  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.97 
 
 
160 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  44.16 
 
 
173 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  40.79 
 
 
152 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  36.84 
 
 
153 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  36.84 
 
 
154 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  40.52 
 
 
165 aa  103  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  103  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  103  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
159 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
159 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 
167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 
159 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  36.84 
 
 
154 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 
159 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  31.82 
 
 
157 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 
159 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 
159 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 
153 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  34.44 
 
 
157 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  34.39 
 
 
159 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 
159 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  39.87 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  33.76 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  37.75 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  37.18 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  32.05 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  32.69 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  40.91 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
159 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  41.72 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  32.89 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  34.67 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.01 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  29.87 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  39.13 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  39.74 
 
 
145 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  40.13 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  33.12 
 
 
160 aa  92  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  30.07 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 
177 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  39.35 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  36.96 
 
 
194 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  36.42 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  32.68 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  31.82 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  34.67 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  35.44 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  33.55 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  38.96 
 
 
158 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  27.56 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  35.53 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  28.29 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  32.03 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  34.87 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  28.57 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  35.26 
 
 
159 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  34.87 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  38.71 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  39.61 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  37.01 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  35.26 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  39.07 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  36.42 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  32.67 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  32.48 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>