More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0051 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  100 
 
 
317 aa  638  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  58.31 
 
 
310 aa  357  1e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  56.16 
 
 
312 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  57.25 
 
 
333 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  57.61 
 
 
336 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  55.63 
 
 
303 aa  328  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  57.25 
 
 
336 aa  327  1e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.8 
 
 
336 aa  325  8e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.56 
 
 
309 aa  313  3e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  51.49 
 
 
311 aa  313  4e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  51.49 
 
 
311 aa  313  4e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  49 
 
 
310 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.83 
 
 
310 aa  308  1e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  51.84 
 
 
308 aa  305  5e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  51.51 
 
 
308 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  51.66 
 
 
309 aa  303  3e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.65 
 
 
312 aa  302  5e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.35 
 
 
311 aa  302  5e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  50 
 
 
317 aa  302  6e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.32 
 
 
309 aa  301  7e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.83 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.83 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.83 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  50.83 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  51.01 
 
 
311 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  51.01 
 
 
311 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.83 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.83 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.83 
 
 
315 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  51.01 
 
 
311 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.16 
 
 
315 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  49.65 
 
 
311 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  51.06 
 
 
310 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.3 
 
 
311 aa  289  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  50 
 
 
306 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  48.95 
 
 
314 aa  288  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.95 
 
 
310 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.95 
 
 
310 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.95 
 
 
310 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  49.66 
 
 
305 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.99 
 
 
303 aa  286  3e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.99 
 
 
304 aa  286  3e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  48.25 
 
 
312 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  48.25 
 
 
312 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  48.25 
 
 
312 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  48.25 
 
 
312 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  48.01 
 
 
303 aa  285  6e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.49 
 
 
310 aa  285  6e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  48.95 
 
 
310 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  49.82 
 
 
312 aa  283  2e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  49.3 
 
 
312 aa  284  2e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  47.9 
 
 
315 aa  283  4e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  48.95 
 
 
311 aa  283  4e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  48.15 
 
 
303 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  49.48 
 
 
305 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.18 
 
 
305 aa  277  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.87 
 
 
305 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.66 
 
 
316 aa  274  1e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  50.5 
 
 
304 aa  270  3e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.5 
 
 
304 aa  270  3e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  43.88 
 
 
308 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.29 
 
 
311 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.29 
 
 
311 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.09206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.29 
 
 
311 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  44.88 
 
 
309 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  43.62 
 
 
310 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  42.19 
 
 
311 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.15645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.62 
 
 
311 aa  265  9e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  45.65 
 
 
367 aa  263  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  41.53 
 
 
311 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  43.39 
 
 
315 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  42.42 
 
 
314 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  41.53 
 
 
311 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  41.53 
 
 
311 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  41.53 
 
 
311 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  50.35 
 
 
309 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  41.55 
 
 
309 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  46.26 
 
 
312 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  46.26 
 
 
312 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.44 
 
 
304 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  45.58 
 
 
312 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  46.98 
 
 
311 aa  254  2e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  48.19 
 
 
318 aa  252  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  46.32 
 
 
427 aa  241  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  41.32 
 
 
319 aa  233  4e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.23 
 
 
312 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.35 
 
 
325 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  41.47 
 
 
336 aa  221  2e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  37.66 
 
 
326 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  38.54 
 
 
311 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  39.04 
 
 
321 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  37.71 
 
 
319 aa  216  6e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  39.57 
 
 
329 aa  213  2e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  40 
 
 
331 aa  213  3e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  40.65 
 
 
336 aa  213  3e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  39.74 
 
 
321 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.13 
 
 
359 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  39.74 
 
 
321 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  37.81 
 
 
326 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.90764e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  38.69 
 
 
322 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>