More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0009 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 416 aa  855    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 426 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 413 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 400 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 422 aa  363  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.66 
 
 		 423 aa  362  8e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 419 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 419 aa  358  9e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 414 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  46.72 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 429 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 457 aa  352  5.9999999999999994e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 420 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 426 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 423 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  43.06 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 403 aa  341  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 417 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 423 aa  339  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>