More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3530 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  95.06 
 
 		 263 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  47.01 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  46.03 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.55 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.89 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.66 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  31.2 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  31.2 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  34.62 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.08 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  31.08 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.92 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.02 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 259 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 294 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3564  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0635844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  32.44 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.43 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.65 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.43 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.43 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.43 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.43 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.47 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.56 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.47 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.47 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.47 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.56 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.47 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.37 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.47 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  28.74 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>