261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0076 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  69.23 
 
 
183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  58.66 
 
 
179 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  53.93 
 
 
186 aa  177  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  54.24 
 
 
188 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  53.49 
 
 
188 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  51.43 
 
 
188 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  50.29 
 
 
188 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  49.44 
 
 
202 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
188 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  48.57 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  47.16 
 
 
197 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  46.59 
 
 
194 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  42.46 
 
 
183 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  33.1 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  30.5 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  30.54 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  31.21 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
342 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  30.5 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  29.41 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  29.75 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  27.97 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  23.73 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
248 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
240 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
221 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
221 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.43 
 
 
359 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  23.76 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
228 aa  58.9  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.14 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  30.71 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  29.03 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  25.41 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  27.22 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  27.22 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  25.27 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.27 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  30.71 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  25.27 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  26.26 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.27 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 
196 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  30 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
180 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  30.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  25.27 
 
 
187 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
180 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 
210 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
180 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
221 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30 
 
 
359 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  24.02 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.29 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  24.54 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.29 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.29 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  27.59 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  25 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  25.27 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  26.63 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  25 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>