More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2469 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  49.02 
 
 		 768 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  55.59 
 
 		 789 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  53.66 
 
 		 714 aa  768    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 724 aa  1478    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  55.72 
 
 		 719 aa  784    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  54.38 
 
 		 719 aa  758    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  41.89 
 
 		 681 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  39.5 
 
 		 754 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  39.58 
 
 		 717 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  40.03 
 
 		 702 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 733 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  37.78 
 
 		 742 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  39.18 
 
 		 725 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 745 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  39.18 
 
 		 726 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  38.52 
 
 		 700 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.39 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  39.24 
 
 		 726 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  37.7 
 
 		 689 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  38.67 
 
 		 686 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  38.38 
 
 		 688 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  37.76 
 
 		 685 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  38.62 
 
 		 687 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  39.71 
 
 		 725 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 702 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  38.34 
 
 		 710 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  38.66 
 
 		 686 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  36.49 
 
 		 669 aa  375  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  38.28 
 
 		 712 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  37.8 
 
 		 689 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  36.32 
 
 		 720 aa  365  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  36.46 
 
 		 708 aa  364  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  37.48 
 
 		 745 aa  363  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  35.96 
 
 		 694 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  36.62 
 
 		 750 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  37.78 
 
 		 687 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  36.48 
 
 		 668 aa  356  6.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 716 aa  353  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 716 aa  353  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  36.68 
 
 		 648 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  36.68 
 
 		 648 aa  352  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  35.42 
 
 		 655 aa  347  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.38 
 
 		 755 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.03 
 
 		 765 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  31.69 
 
 		 749 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  30.58 
 
 		 769 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  33.7 
 
 		 630 aa  325  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.41 
 
 		 741 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  32.82 
 
 		 656 aa  323  6e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  31.93 
 
 		 706 aa  322  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  34 
 
 		 706 aa  320  7.999999999999999e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  32.98 
 
 		 728 aa  319  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  31.44 
 
 		 757 aa  317  5e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 755 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  32.68 
 
 		 833 aa  312  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  35.4 
 
 		 676 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.81 
 
 		 772 aa  308  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  32.63 
 
 		 707 aa  308  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.86 
 
 		 742 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  32.9 
 
 		 736 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  35 
 
 		 715 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.95 
 
 		 739 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 816 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.35 
 
 		 751 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  32.65 
 
 		 804 aa  305  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.93 
 
 		 729 aa  305  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.24 
 
 		 751 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.3 
 
 		 711 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.76 
 
 		 731 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  32.04 
 
 		 790 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  31.07 
 
 		 764 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.84 
 
 		 892 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 		 850 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  32.85 
 
 		 723 aa  302  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  31.08 
 
 		 760 aa  301  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  32.45 
 
 		 720 aa  300  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.55 
 
 		 759 aa  300  7e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  32.54 
 
 		 858 aa  300  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  33.69 
 
 		 726 aa  300  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.19 
 
 		 768 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  32.43 
 
 		 770 aa  299  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  30.5 
 
 		 778 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  33.64 
 
 		 725 aa  299  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  30.5 
 
 		 706 aa  299  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 709 aa  299  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  32.22 
 
 		 762 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  33.8 
 
 		 709 aa  299  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  31.52 
 
 		 758 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 		 786 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  31.15 
 
 		 783 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.28 
 
 		 783 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.61 
 
 		 816 aa  296  7e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.18 
 
 		 685 aa  296  7e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.32 
 
 		 730 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.32 
 
 		 730 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  31.61 
 
 		 789 aa  295  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.2 
 
 		 737 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4021  UvrD/REP helicase  34.16 
 
 		 848 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  32.32 
 
 		 765 aa  295  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6141  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.01 
 
 		 855 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0790722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>