More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0955 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  63.61 
 
 
312 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  56.57 
 
 
302 aa  352  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  53.04 
 
 
309 aa  332  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  53.87 
 
 
302 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  52.36 
 
 
309 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  52.35 
 
 
300 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  55.22 
 
 
303 aa  323  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  54.55 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  51.52 
 
 
301 aa  318  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  53.02 
 
 
302 aa  315  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  52.63 
 
 
290 aa  314  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  53.87 
 
 
303 aa  312  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  50.84 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  52.67 
 
 
282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  54.12 
 
 
283 aa  305  7e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  50.51 
 
 
303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  53.21 
 
 
296 aa  300  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  50.84 
 
 
303 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  51.69 
 
 
302 aa  285  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  47.47 
 
 
306 aa  265  8e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  47.67 
 
 
279 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  44.93 
 
 
285 aa  258  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  48.06 
 
 
286 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  46.32 
 
 
289 aa  256  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  40.79 
 
 
294 aa  255  7e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  47.35 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  47.35 
 
 
286 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  44.2 
 
 
286 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  44.06 
 
 
298 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  45.16 
 
 
283 aa  248  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  44.06 
 
 
298 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  45.39 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  45 
 
 
286 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  45.91 
 
 
278 aa  244  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  47.12 
 
 
283 aa  242  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  43.46 
 
 
284 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  42.75 
 
 
285 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  43.36 
 
 
298 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  43.32 
 
 
280 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  43.22 
 
 
277 aa  238  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.82 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  43.9 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  44.13 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  43.68 
 
 
294 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  43.27 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  41.58 
 
 
293 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  43.01 
 
 
284 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  42.6 
 
 
284 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  44.22 
 
 
299 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  39.72 
 
 
287 aa  226  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  42.7 
 
 
299 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  41.55 
 
 
284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  44.76 
 
 
298 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  42.09 
 
 
290 aa  225  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  42.09 
 
 
290 aa  225  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  42.5 
 
 
299 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  42.41 
 
 
288 aa  224  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  42.18 
 
 
283 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  39.86 
 
 
285 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  41.99 
 
 
284 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  42.37 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  39.86 
 
 
274 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  37.81 
 
 
279 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  43.06 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  36.81 
 
 
293 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  37.98 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  40.5 
 
 
283 aa  194  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  36.3 
 
 
288 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  36.69 
 
 
282 aa  191  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
290 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  41.61 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  39.15 
 
 
282 aa  188  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  36.04 
 
 
282 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  41.38 
 
 
292 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  40.91 
 
 
290 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  37.17 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  38.46 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  40.42 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  34.17 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  39.31 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  39.42 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  40.43 
 
 
290 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
290 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  40.43 
 
 
290 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  39.45 
 
 
290 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  35.14 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  40.43 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  34.78 
 
 
285 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  37.5 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  34.78 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  39.21 
 
 
284 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  34.42 
 
 
285 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  41.03 
 
 
292 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  34.66 
 
 
285 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>