101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0335 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  66.91 
 
 
278 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  63.57 
 
 
280 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  63.74 
 
 
276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  61.8 
 
 
275 aa  346  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  59.15 
 
 
297 aa  340  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  58.12 
 
 
280 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  56.82 
 
 
268 aa  331  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  55.76 
 
 
286 aa  329  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  58.63 
 
 
282 aa  328  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  57.14 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  57.14 
 
 
284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  57.61 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  58.43 
 
 
277 aa  325  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  58.05 
 
 
279 aa  324  9e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  58.04 
 
 
283 aa  322  6e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  56.87 
 
 
274 aa  317  9e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  55.68 
 
 
274 aa  315  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  56.06 
 
 
274 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  55.47 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  63.82 
 
 
296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  57.79 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  55.83 
 
 
272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  50.56 
 
 
269 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  52.63 
 
 
278 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  55.69 
 
 
276 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  54.51 
 
 
292 aa  290  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  52.76 
 
 
283 aa  289  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  56.15 
 
 
279 aa  288  7e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  50.37 
 
 
276 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  50.76 
 
 
283 aa  275  7e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  48.44 
 
 
301 aa  249  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  42.37 
 
 
272 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  28.85 
 
 
350 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  36.28 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  34.15 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  31.28 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  36 
 
 
330 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  32 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  32.14 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  26.05 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  34.41 
 
 
338 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  30.83 
 
 
354 aa  50.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.78 
 
 
633 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  38.6 
 
 
70 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  31.65 
 
 
620 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.11 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  36.78 
 
 
633 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.08 
 
 
640 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  31.43 
 
 
354 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  38.57 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  38.57 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  37.68 
 
 
388 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  42.37 
 
 
684 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  42.37 
 
 
683 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  42.37 
 
 
684 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  37.1 
 
 
447 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.14 
 
 
326 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  29.59 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.14 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  42.11 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  30.43 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  30.56 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  38.98 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.29 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  32.86 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.52 
 
 
608 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  32.81 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  34.33 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  33.71 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.67 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.67 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  37.88 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  38.98 
 
 
689 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  28.07 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  35.63 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  36.51 
 
 
828 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  39.34 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.88 
 
 
629 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  25 
 
 
336 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  39.73 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  35.21 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  37.04 
 
 
348 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  30.53 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  28.1 
 
 
349 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  28.18 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  38.98 
 
 
1156 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35 
 
 
584 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  30.43 
 
 
265 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  34.83 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06641  naphthoate synthase  37.7 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.72 
 
 
621 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  38.98 
 
 
651 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  38.98 
 
 
651 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  38.2 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.53 
 
 
590 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  27.78 
 
 
327 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.56 
 
 
620 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  38.27 
 
 
347 aa  42.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  30.43 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>