More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3652 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  67.91 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  71.12 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  67.38 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  50.53 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  52.15 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  50.54 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  50.54 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  49.74 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  48.39 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  48.39 
 
 		 196 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  48.39 
 
 		 196 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  48.39 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  48.39 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  48.39 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  48.39 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  48.39 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  48.39 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  47.85 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  48.4 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  48.92 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  48.92 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 193 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  48.92 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  47.87 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  43.17 
 
 		 318 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  44.26 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  49.33 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  42.86 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  46.1 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.82 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  40.76 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  40.76 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  40.76 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.88 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  41.29 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  40.88 
 
 		 184 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.71 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 206 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.33 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.26 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  42.11 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.02 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.43 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  41.4 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  36.96 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.38 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.74 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.46 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  35.48 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  36.32 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 196 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.9 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  41.94 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  41.94 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  41.94 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.18 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  37.89 
 
 		 213 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  33.7 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  37.43 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  38.59 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  40.64 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  36.7 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.7 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.7 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  37.7 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  39.01 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  39.01 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  37.16 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>