More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2834 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
671 aa  1354    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 
674 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 
666 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 
679 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2188  histidine kinase  43.94 
 
 
540 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.035953  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 
644 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000893288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
544 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.61 
 
 
535 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  40.62 
 
 
645 aa  237  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
543 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  42.23 
 
 
541 aa  227  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
680 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 
659 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  40.67 
 
 
549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2644  chemotaxis transducer  47.27 
 
 
280 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 
540 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  41.95 
 
 
533 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 
550 aa  220  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  43.63 
 
 
549 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 
642 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.0148687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 
539 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
674 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 
549 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  29.43 
 
 
676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
661 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.32 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5093  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 
676 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.2 
 
 
544 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 
570 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
547 aa  213  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
540 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 
545 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40.58 
 
 
642 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
547 aa  210  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.66 
 
 
540 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1902  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
547 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.87 
 
 
557 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
540 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  39.77 
 
 
676 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 
653 aa  208  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  39.42 
 
 
544 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 
653 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 
542 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
621 aa  207  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 
549 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
681 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.29 
 
 
540 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  41.4 
 
 
544 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 
537 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 
569 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
642 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  39.87 
 
 
539 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
542 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 
549 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
550 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 
541 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  39.69 
 
 
544 aa  204  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
547 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  38.48 
 
 
539 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.21 
 
 
537 aa  203  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 
564 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 
640 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 
620 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  40.63 
 
 
541 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 
535 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  38.02 
 
 
549 aa  200  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.32 
 
 
538 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
533 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.32 
 
 
542 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 
423 aa  199  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.91 
 
 
535 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 
565 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 
544 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.63 
 
 
700 aa  196  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2698  methyl-accepting chemotaxis protein I  26.33 
 
 
640 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
601 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 
620 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
493 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.63 
 
 
572 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 
626 aa  194  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
620 aa  194  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
563 aa  194  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.24 
 
 
546 aa  194  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
551 aa  193  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 
548 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2287  putative chemotaxis transducer  40.32 
 
 
490 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27000  putative chemotaxis transducer  40.32 
 
 
490 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 
541 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 
392 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 
549 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
720 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 
537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
533 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2059  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
491 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116428  normal  0.539616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>