More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1902 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1902  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 547 aa  1088    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 		 671 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3811  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0164007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.57 
 
 		 674 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5361  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 508 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0926  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 572 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  31.73 
 
 		 549 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 		 550 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.64 
 
 		 551 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  29.14 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 570 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 		 549 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.26 
 
 		 540 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1108  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.88 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.92 
 
 		 674 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3621  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.62 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.30858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 544 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 544 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 		 637 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 544 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 666 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2188  histidine kinase  30.44 
 
 		 540 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.035953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  34.22 
 
 		 619 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37 
 
 		 537 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.19 
 
 		 564 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.98 
 
 		 533 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.02 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  28 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  33.64 
 
 		 540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.63 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  31.56 
 
 		 658 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  32.65 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.75 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  30.34 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 		 648 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4750  chemotaxis signal transducer  31.77 
 
 		 563 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4769  methyl-accepting chemotaxis protein  31.77 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000157203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5150  chemotaxis signal transducer  31.77 
 
 		 563 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000223621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5195  methyl-accepting chemotaxis protein  31.77 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 646 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.49 
 
 		 539 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  32.68 
 
 		 549 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5181  methyl-accepting chemotaxis protein  29.53 
 
 		 563 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000942928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 		 533 aa  151  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 538 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 		 620 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3579  chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 		 554 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  31.32 
 
 		 658 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  31.32 
 
 		 658 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 542 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.59 
 
 		 549 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 563 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 542 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.93 
 
 		 563 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  29.59 
 
 		 620 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 674 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 839 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5186  methyl-accepting chemotaxis protein  28.98 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  31.58 
 
 		 658 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  28.6 
 
 		 660 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.79 
 
 		 680 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  32.49 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  29.66 
 
 		 392 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.71 
 
 		 650 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0674  PAS  31.49 
 
 		 544 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 661 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.11 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  31.84 
 
 		 658 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  31.58 
 
 		 658 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.32 
 
 		 526 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  31.32 
 
 		 658 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 		 620 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.37 
 
 		 648 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 		 511 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51282  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 		 647 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 		 535 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.95 
 
 		 538 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 		 563 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0063  methyl-accepting chemotaxis protein  29.61 
 
 		 563 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000482836  normal  0.0217071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  31.67 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.78 
 
 		 647 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  31.51 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 		 526 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837654  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  35.22 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>