More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0465 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0465  patatin  100 
 
 		 729 aa  1478    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  37.71 
 
 		 750 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  37.9 
 
 		 777 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.55 
 
 		 727 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.29 
 
 		 728 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.49 
 
 		 728 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  33.02 
 
 		 790 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  32.88 
 
 		 745 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.02 
 
 		 751 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.93 
 
 		 748 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.61 
 
 		 728 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.79 
 
 		 728 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32.32 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  28.73 
 
 		 738 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  29.86 
 
 		 736 aa  325  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  28.73 
 
 		 738 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.64 
 
 		 767 aa  324  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.43 
 
 		 753 aa  324  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.27 
 
 		 738 aa  323  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  28.53 
 
 		 738 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  30.19 
 
 		 751 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  28.61 
 
 		 737 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.06 
 
 		 728 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.51 
 
 		 796 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  30.34 
 
 		 734 aa  317  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.9 
 
 		 735 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  29.25 
 
 		 738 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  30.56 
 
 		 804 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  29.25 
 
 		 738 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  30.83 
 
 		 728 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  30.83 
 
 		 933 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.46 
 
 		 737 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  30.83 
 
 		 945 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.84 
 
 		 798 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  31.06 
 
 		 852 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  29.42 
 
 		 739 aa  311  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  30.73 
 
 		 920 aa  310  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  30.73 
 
 		 930 aa  310  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.65 
 
 		 754 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  31.76 
 
 		 813 aa  308  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.52 
 
 		 738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.8 
 
 		 803 aa  303  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.8 
 
 		 803 aa  303  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  29.75 
 
 		 737 aa  302  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.66 
 
 		 803 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  30.12 
 
 		 714 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  28.25 
 
 		 741 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  28.84 
 
 		 735 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.56 
 
 		 667 aa  280  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  28.93 
 
 		 776 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  27.52 
 
 		 771 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  29.56 
 
 		 745 aa  249  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  27.22 
 
 		 733 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  28.19 
 
 		 764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  30.57 
 
 		 720 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.7 
 
 		 746 aa  177  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  27.68 
 
 		 740 aa  171  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.06 
 
 		 760 aa  170  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  35.67 
 
 		 272 aa  160  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.03 
 
 		 256 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  33.33 
 
 		 275 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  36 
 
 		 333 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.74 
 
 		 253 aa  147  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  35.86 
 
 		 318 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.33 
 
 		 320 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33.44 
 
 		 275 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  35.6 
 
 		 311 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.33 
 
 		 320 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.18 
 
 		 260 aa  144  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  35.74 
 
 		 318 aa  143  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.63 
 
 		 311 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  30 
 
 		 707 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  32.92 
 
 		 310 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.67 
 
 		 275 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.48 
 
 		 293 aa  142  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.07 
 
 		 740 aa  142  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.92 
 
 		 263 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.92 
 
 		 263 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.92 
 
 		 263 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.57 
 
 		 263 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  33.92 
 
 		 263 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.92 
 
 		 263 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  33.57 
 
 		 263 aa  140  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.92 
 
 		 263 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.29 
 
 		 273 aa  140  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.57 
 
 		 263 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  33.12 
 
 		 292 aa  139  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.91 
 
 		 316 aa  138  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.9 
 
 		 302 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.22 
 
 		 263 aa  137  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.85 
 
 		 319 aa  137  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.69 
 
 		 298 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.32 
 
 		 263 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  33.75 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.23 
 
 		 320 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.53 
 
 		 330 aa  134  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  32.75 
 
 		 314 aa  134  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  38.99 
 
 		 315 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  32.74 
 
 		 259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>