More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0648 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  100 
 
 
188 aa  360  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 
209 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  37.97 
 
 
183 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36.84 
 
 
204 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40 
 
 
225 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6428  GrpE protein  44.76 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  41.77 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  34.01 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  39.57 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  35.92 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
205 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  35.93 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  26.26 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  30.54 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  34.27 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 
191 aa  92  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.13 
 
 
208 aa  91.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.77 
 
 
189 aa  90.9  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.22 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  37.06 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  35.15 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  39.57 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  36.42 
 
 
156 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  31.94 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.26 
 
 
246 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  29.71 
 
 
217 aa  89  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.52 
 
 
187 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  34.69 
 
 
185 aa  89  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.64 
 
 
243 aa  89  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  32.14 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  42.66 
 
 
224 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  36.81 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  31.01 
 
 
210 aa  88.2  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
201 aa  87.8  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  32.1 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  37.86 
 
 
201 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  39.62 
 
 
173 aa  87  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.29 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 
213 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  33.57 
 
 
274 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.17 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  40 
 
 
244 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  38.73 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.69 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  31.11 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  31.51 
 
 
172 aa  85.5  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  35.62 
 
 
221 aa  85.1  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  37.04 
 
 
260 aa  84.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  36.77 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  32.45 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  30.26 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.01 
 
 
282 aa  84  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.31 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  32.67 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  32.97 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  30.56 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  28.77 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.9 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  31.51 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  35.16 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  33.85 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  32.64 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.03 
 
 
231 aa  82  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  31.13 
 
 
198 aa  82  0.000000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.73 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0095  GrpE protein  25.14 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0826396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>