More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0095 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0095  GrpE protein  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0826396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.68 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  29.87 
 
 		 245 aa  87.8  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  29.38 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  27.27 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  30.64 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  30.64 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  30.64 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  30.64 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  30.64 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  30.64 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  31.21 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  30.06 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  26.95 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  30.64 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  30.94 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  30.52 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  30.07 
 
 		 228 aa  84.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  30.82 
 
 		 213 aa  84.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  27.97 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  29.33 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  26.32 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  27.97 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.47 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  32.24 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  27.96 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  26.71 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  26.62 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.92 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  29.03 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  27.54 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  27.78 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  28 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  29.93 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  29.81 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.11 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  30.71 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  28.98 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  27.27 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  27.7 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  29.86 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  28 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  28 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  30.2 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  32.05 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  26.78 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  29.45 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  29.17 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  28.77 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  28.49 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  27.86 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  31.25 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  28.05 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  29.93 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  26.92 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  27.74 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.74 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  30 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  29.94 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  26.01 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  27.92 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  25.41 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  30.43 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  26.63 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  31.25 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  27.03 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0168  co-chaperone GrpE  30.77 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  27.4 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  27.13 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.97 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  33.1 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  23.7 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  26.32 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  28.47 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.54 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  28.35 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  27.33 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  31.37 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  29.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  26.95 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  28.99 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  26.39 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>