More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0342 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
482 aa  927    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.84 
 
 
483 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  53.45 
 
 
454 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
478 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  53.09 
 
 
453 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  52.53 
 
 
422 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  49.89 
 
 
461 aa  349  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.51 
 
 
468 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.36 
 
 
468 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  44.04 
 
 
470 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
470 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.87 
 
 
498 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
547 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.06 
 
 
517 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 
480 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 
461 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.62 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  28.88 
 
 
479 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  26.72 
 
 
480 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  25.87 
 
 
480 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
478 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  32.47 
 
 
484 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
477 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 
477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  26.97 
 
 
476 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
477 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  25.37 
 
 
485 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  33.48 
 
 
493 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.84 
 
 
500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.62 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.17 
 
 
477 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
520 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.96 
 
 
503 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
476 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.79 
 
 
473 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.17 
 
 
483 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
473 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
494 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
497 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.72 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  30.62 
 
 
514 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
469 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 
480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.13 
 
 
476 aa  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.9 
 
 
483 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  26.68 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  30.23 
 
 
494 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.68 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  30.28 
 
 
476 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  26.45 
 
 
468 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.68 
 
 
480 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  32.4 
 
 
473 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 
554 aa  150  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.74 
 
 
471 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 
480 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
496 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
487 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0204  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
481 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.67 
 
 
461 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.65 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  33.15 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  27.43 
 
 
463 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  29.27 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 
400 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  27.51 
 
 
482 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  28.99 
 
 
478 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  28.41 
 
 
469 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  25.9 
 
 
405 aa  144  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
398 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  23.41 
 
 
442 aa  144  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  23.41 
 
 
442 aa  144  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
478 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
478 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
473 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
492 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  28.51 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  28.27 
 
 
473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.81 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  27.67 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>