262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2244 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 489 aa  998    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  54.52 
 
 		 708 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  37.17 
 
 		 525 aa  299  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  39.64 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  35.95 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  33.27 
 
 		 541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 		 531 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  30.94 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  34.94 
 
 		 838 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  29.08 
 
 		 532 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 		 583 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  38.31 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  28.11 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  28.37 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  31.41 
 
 		 637 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  28.25 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  34.58 
 
 		 858 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  34.58 
 
 		 858 aa  163  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  27.39 
 
 		 464 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.72 
 
 		 519 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  27.18 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  25.58 
 
 		 482 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  33.7 
 
 		 570 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  38.59 
 
 		 620 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  33.83 
 
 		 858 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  25.25 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  25.87 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 463 aa  152  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 		 846 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  32.61 
 
 		 818 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  35.36 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  26.37 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 847 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  30.85 
 
 		 613 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  28.77 
 
 		 623 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 		 465 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  24.65 
 
 		 472 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  27.29 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  25.26 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  23.91 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 		 482 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  24.27 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  30.6 
 
 		 697 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  23.31 
 
 		 482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  31.98 
 
 		 560 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 		 627 aa  118  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  26.07 
 
 		 696 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.27 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  29.74 
 
 		 702 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 		 698 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  25.49 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0208  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.750314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  25.36 
 
 		 455 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 		 588 aa  113  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  24.27 
 
 		 628 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.72 
 
 		 920 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 		 680 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 		 638 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  23.91 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 		 466 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  24.85 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  22.89 
 
 		 457 aa  106  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  28.67 
 
 		 680 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  22.82 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  23.09 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 		 631 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  32.06 
 
 		 631 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1758  flagellar hook-associated protein FlgK  22.59 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1814  flagellar hook-associated protein FlgK  22.59 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  28.61 
 
 		 647 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  22.92 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  23.61 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  23.7 
 
 		 653 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  23.3 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 		 640 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  26.7 
 
 		 685 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 		 549 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  22.95 
 
 		 547 aa  100  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  23.12 
 
 		 457 aa  100  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 		 645 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 		 645 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 		 686 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 		 683 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.58 
 
 		 637 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  24.64 
 
 		 608 aa  98.2  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  24.64 
 
 		 608 aa  97.8  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  26.98 
 
 		 623 aa  97.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 649 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 		 690 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.23 
 
 		 695 aa  97.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  24.64 
 
 		 608 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 683 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>