More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1707 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 229 aa  460  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  67.56 
 
 		 232 aa  321  6e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  66.22 
 
 		 232 aa  317  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  65.33 
 
 		 232 aa  315  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  65.33 
 
 		 232 aa  314  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  65.33 
 
 		 229 aa  311  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  67.56 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  62.05 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  61.88 
 
 		 232 aa  295  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  58.56 
 
 		 229 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  57.28 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  55.86 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  56.31 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  54.3 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  53.18 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  53.39 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  55.86 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  54.05 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 234 aa  248  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  50.89 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 236 aa  248  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.14 
 
 		 233 aa  247  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  52.94 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 234 aa  245  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  51.1 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  52.44 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  48.64 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  50.45 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  52.94 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  48.89 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  51.82 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  50.68 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  51.13 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  49.77 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 238 aa  238  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  237  9e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  50.23 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  50.23 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  50.23 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  50.23 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3643  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 235 aa  234  9e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  49.09 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  51.33 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>