201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0218 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  51.03 
 
 		 772 aa  838    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  49.57 
 
 		 780 aa  700    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  51.54 
 
 		 772 aa  845    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  54.47 
 
 		 779 aa  851    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  52.19 
 
 		 764 aa  843    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  50.9 
 
 		 772 aa  838    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  51.03 
 
 		 772 aa  839    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  54.78 
 
 		 775 aa  808    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  51.03 
 
 		 772 aa  839    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  55.46 
 
 		 749 aa  835    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  55.57 
 
 		 681 aa  777    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  50.2 
 
 		 760 aa  765    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  53.2 
 
 		 772 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  50.63 
 
 		 760 aa  748    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  50.26 
 
 		 763 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  52.09 
 
 		 771 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  48.88 
 
 		 712 aa  690    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  55.19 
 
 		 775 aa  879    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  53.2 
 
 		 772 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  46.38 
 
 		 823 aa  701    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  53.2 
 
 		 772 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  55.9 
 
 		 772 aa  893    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  51.48 
 
 		 775 aa  841    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  53.2 
 
 		 772 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  52.17 
 
 		 772 aa  843    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  51.79 
 
 		 764 aa  839    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  50.48 
 
 		 763 aa  734    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  60.22 
 
 		 770 aa  941    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  50.9 
 
 		 772 aa  837    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  50.9 
 
 		 772 aa  838    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  52.76 
 
 		 804 aa  780    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  50.9 
 
 		 772 aa  838    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  51.35 
 
 		 772 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  55.18 
 
 		 774 aa  875    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 		 780 aa  1617    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  52.67 
 
 		 766 aa  792    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  51.36 
 
 		 777 aa  796    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  36.25 
 
 		 765 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  36.07 
 
 		 760 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  41.52 
 
 		 765 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  37.85 
 
 		 608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  39.59 
 
 		 795 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  39.6 
 
 		 757 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  36.57 
 
 		 794 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  33.49 
 
 		 799 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 		 778 aa  339  9e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.32 
 
 		 695 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.61 
 
 		 770 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  30.67 
 
 		 752 aa  295  2e-78  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 		 784 aa  290  7e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.27 
 
 		 768 aa  273  7e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  29.7 
 
 		 755 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.97 
 
 		 792 aa  264  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.58 
 
 		 828 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.46 
 
 		 801 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.64 
 
 		 779 aa  254  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.1 
 
 		 799 aa  251  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.93 
 
 		 821 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  30.02 
 
 		 779 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  29.37 
 
 		 746 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.81 
 
 		 836 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 797 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.58 
 
 		 752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  29.17 
 
 		 794 aa  233  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.77 
 
 		 779 aa  232  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.29 
 
 		 785 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 		 803 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  26.03 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.45 
 
 		 806 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.75 
 
 		 845 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.52 
 
 		 700 aa  212  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 813 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.79 
 
 		 839 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  27.13 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  25.7 
 
 		 776 aa  206  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  25.74 
 
 		 798 aa  204  7e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.37 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  25.88 
 
 		 816 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  25.83 
 
 		 728 aa  198  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.76 
 
 		 803 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.26 
 
 		 803 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  26.89 
 
 		 661 aa  196  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  25.62 
 
 		 715 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  25.94 
 
 		 715 aa  195  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  26.31 
 
 		 803 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.6 
 
 		 806 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  28.38 
 
 		 840 aa  188  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  24.38 
 
 		 692 aa  188  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 806 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 806 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  23.56 
 
 		 828 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 806 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  26.69 
 
 		 806 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  25.28 
 
 		 784 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  22.69 
 
 		 825 aa  184  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  23.34 
 
 		 821 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  26.21 
 
 		 656 aa  182  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  26.57 
 
 		 1024 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  25 
 
 		 702 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  26.78 
 
 		 667 aa  181  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>