More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0128 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 443 aa  880    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  36.3 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 449 aa  255  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  34.14 
 
 		 452 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  30.64 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 443 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 438 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 438 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.88 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.88 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  29.79 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 440 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 440 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  24.75 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 474 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  22.92 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  25.28 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  24.66 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  24.47 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  24.47 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 716 aa  77.4  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  24.47 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  24.47 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  24.04 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  24.04 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  24.47 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  24.04 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  25.27 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  25.94 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.71 
 
 		 609 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25.14 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  24.47 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  27.87 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  24.78 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  22.25 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  24.31 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  23.39 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  22.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  24.65 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  24.65 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  24.65 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  24.65 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  24.65 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0683  amino acid transporter protein  24.76 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  23.85 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  24.63 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  24.94 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  21.81 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf753  amino acid permease  24.63 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  24.63 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  22.4 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  24.38 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  24.63 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  24.63 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  24.63 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl664  putrescine/ornithine APC transporter  25.82 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  24.84 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  24.38 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  22.51 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>