49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2135 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  55.46 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  43.46 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  42.92 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  39.17 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  38.55 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  40.59 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  39.57 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  37.28 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  36.36 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  36 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  35.4 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  33.64 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  32.46 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  32.02 
 
 		 195 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  36.4 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  31.58 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  32.61 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  34.4 
 
 		 190 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.57 
 
 		 206 aa  88.6  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  32.85 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  30.77 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  31.68 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.19 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  27.27 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  29.17 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  27.73 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  29.57 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  26.83 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  26.98 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  27.05 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  34.17 
 
 		 288 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.92 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  28.37 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  27.98 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  27.98 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  31.35 
 
 		 373 aa  45.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.8 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.8 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  28.8 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.8 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  31.75 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  30.28 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  31.11 
 
 		 219 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  30.73 
 
 		 357 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  26.56 
 
 		 212 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>