285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1879 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  64.13 
 
 		 222 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  59.09 
 
 		 220 aa  264  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  58.8 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  55.51 
 
 		 226 aa  254  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  54.46 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  57.27 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  50.23 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  47 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  47 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  46.01 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  45.16 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  45.02 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  45.37 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  44.7 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  48.17 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  45.24 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  43.81 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  44.24 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  43.78 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  42.59 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  45.62 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  45.16 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  40.28 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  39.81 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  41.86 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  39.63 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  41.71 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  38.72 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  40 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  40.45 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.47 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  39.52 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 		 245 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  38.96 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  39.39 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  43.5 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  35.91 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  35.45 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  34.68 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.36 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  34.76 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  26.27 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  41.12 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  28.33 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  29.18 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  27.97 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  27.8 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  26.98 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  29.82 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  40.19 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  26.72 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  27.9 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  28.14 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.17 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 258 aa  72  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.17 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  27.49 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  38.61 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  40.94 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  26.09 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  27.56 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  30.17 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.35 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>