More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1031 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.39 
 
 
233 aa  374  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.4 
 
 
233 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.25 
 
 
232 aa  367  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.96 
 
 
233 aa  361  6e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  69 
 
 
236 aa  341  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0924  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  69.43 
 
 
232 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
230 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
228 aa  198  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.3 
 
 
209 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
234 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
226 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00421455  normal  0.304991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
226 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00919  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  40.27 
 
 
230 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
231 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
231 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
232 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
244 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
244 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.91 
 
 
244 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
253 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
246 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
252 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
247 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
245 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
264 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
248 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
246 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  36.48 
 
 
257 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  36.48 
 
 
257 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
244 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
245 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
252 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
245 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
257 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  38.68 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
244 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
244 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  36.55 
 
 
255 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
241 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.24 
 
 
230 aa  131  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.66 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
257 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.197802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
257 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
246 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
332 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
249 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.68 
 
 
250 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
254 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
237 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
246 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  34.3 
 
 
245 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
244 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  34.71 
 
 
1270 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
247 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
254 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  35 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  35.96 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
246 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
250 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
240 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
241 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  35.08 
 
 
251 aa  118  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.44 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155421  hitchhiker  0.00000000000159857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4862  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.19 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000522303  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000309791  hitchhiker  0.00252207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000261149  unclonable  0.000000000503217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>