176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1654 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  78.74 
 
 		 421 aa  632  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  74.82 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  75.79 
 
 		 425 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  68.3 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  69.73 
 
 		 419 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  63.82 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  33.97 
 
 		 435 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  32 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  34.74 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  35.68 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  32.84 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 462 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  32.84 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  33.75 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 462 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  32.93 
 
 		 430 aa  206  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  32.46 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  31.99 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  32.23 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  32.23 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  32.23 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  32.23 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  32.23 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  31.99 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  32.23 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 467 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  30.02 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  33.73 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 444 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  31.22 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  29.52 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  30.72 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 492 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  30.49 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  25.85 
 
 		 408 aa  162  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  31.75 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  26.99 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.41 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  26.57 
 
 		 440 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  26.56 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.68 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 437 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.65 
 
 		 474 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 467 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 449 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  29 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 440 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  29.2 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  29.63 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  28.97 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  28.22 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>