More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1309 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  41.1 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  39.18 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  40.91 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  39.73 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.06 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  38.72 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  37.28 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  36.27 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  37.85 
 
 		 292 aa  192  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  37.37 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  28.28 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  29.15 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1077  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158913  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  25.21 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.08 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.02 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.5 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.38 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.78 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.81 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  30.2 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  28.14 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.49 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 435 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  26.64 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  26.81 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  26.25 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  25.71 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.53 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.8 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  24.9 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.53 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.56 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  27.44 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.16 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  28.1 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  26.69 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  26.69 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  26.34 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.08 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  25.54 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  24.36 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  24.57 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.22 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.8 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  25.51 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.19 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  24.89 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  24.89 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  22.63 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  26.5 
 
 		 584 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.05 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.13 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.81 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  28.95 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  26.76 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  36.04 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  24.28 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  29.94 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  26.76 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  22.56 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>