More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1079 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1079  Patatin  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  34.82 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  37.4 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  37.08 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  34.11 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  33.73 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  32.8 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  42.68 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  41.06 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  32.39 
 
 		 740 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  30.62 
 
 		 324 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  37.74 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  26.59 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  30.2 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  36.26 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  30.37 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.79 
 
 		 760 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  26.4 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  27.73 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  28.57 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  27.56 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  38.36 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  34.42 
 
 		 320 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  35.8 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.24 
 
 		 330 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.53 
 
 		 306 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  27.17 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  28.45 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.53 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  27.24 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.53 
 
 		 474 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.53 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.28 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  27.24 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.53 
 
 		 347 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  29.53 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.53 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  27.82 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  34.38 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  29.13 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.83 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  27.21 
 
 		 707 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  29.44 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  26.02 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28.12 
 
 		 728 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  28.51 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.13 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  28.29 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.54 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  31.86 
 
 		 358 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.13 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.73 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.13 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  25.78 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  26.77 
 
 		 311 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  27.07 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27.07 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  28.69 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  28.74 
 
 		 358 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.74 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  35.58 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 748 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  26.75 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  25.27 
 
 		 733 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  33.33 
 
 		 345 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.89 
 
 		 740 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  25.31 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  27.78 
 
 		 728 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.16 
 
 		 303 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  33.12 
 
 		 348 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.74 
 
 		 349 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.93 
 
 		 335 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  33.13 
 
 		 327 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.33 
 
 		 728 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.16 
 
 		 322 aa  99.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.32 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.27 
 
 		 311 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35 
 
 		 300 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.9 
 
 		 346 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  28.96 
 
 		 303 aa  98.6  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.1 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.14 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  32.18 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  27.54 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  27.97 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  35.93 
 
 		 335 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.14 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  32.32 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  35.67 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  29.72 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  32.18 
 
 		 306 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  32.39 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  32.34 
 
 		 346 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  30.84 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4233  patatin  39.31 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  35.12 
 
 		 321 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  32.2 
 
 		 346 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  32.34 
 
 		 346 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  32.52 
 
 		 319 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  33.15 
 
 		 346 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>