132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0273 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 
635 aa  1318  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  3.19347e-09  hitchhiker  1.391e-07 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  52.27 
 
 
632 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.88 
 
 
622 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.04 
 
 
622 aa  615  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.47 
 
 
627 aa  595  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.55 
 
 
629 aa  594  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.61 
 
 
635 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.27 
 
 
625 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.83589e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.38 
 
 
657 aa  579  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.31 
 
 
658 aa  580  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  47.29 
 
 
634 aa  577  1e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.78 
 
 
658 aa  577  1e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  3.90023e-06  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  48.69 
 
 
629 aa  575  1e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.07 
 
 
624 aa  573  1e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.55 
 
 
662 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.07 
 
 
659 aa  539  1e-152  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.0424e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.01 
 
 
667 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.29 
 
 
663 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.81 
 
 
664 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.99 
 
 
664 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  9.90495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.46 
 
 
673 aa  517  1e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.9 
 
 
665 aa  515  1e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.64 
 
 
591 aa  355  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  36.59 
 
 
574 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.91 
 
 
590 aa  343  6e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.17 
 
 
594 aa  315  1e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.23 
 
 
579 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.63 
 
 
566 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  33.55 
 
 
563 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.52 
 
 
574 aa  166  1e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.83064e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  26.26 
 
 
576 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  26.92 
 
 
569 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  25.28 
 
 
574 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  25.28 
 
 
574 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  27.25 
 
 
578 aa  157  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  26.51 
 
 
574 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  26.68 
 
 
578 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  27.18 
 
 
579 aa  153  9e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  27.04 
 
 
579 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  26.16 
 
 
578 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  26.95 
 
 
579 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  26.95 
 
 
579 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.66 
 
 
591 aa  149  1e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  27.12 
 
 
582 aa  147  4e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  26.41 
 
 
582 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  27.16 
 
 
579 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  26.65 
 
 
580 aa  143  1e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  27 
 
 
579 aa  142  2e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  26.84 
 
 
579 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  26.23 
 
 
574 aa  138  3e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  26.74 
 
 
583 aa  130  7e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  26.27 
 
 
954 aa  122  2e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  24.92 
 
 
580 aa  119  1e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.12 
 
 
610 aa  113  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  23.52 
 
 
573 aa  110  9e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.64 
 
 
556 aa  82.8  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
641 aa  72.8  2e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.55 
 
 
601 aa  69.3  2e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.11 
 
 
564 aa  62.8  2e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  7.07251e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.02 
 
 
583 aa  59.7  2e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.12 
 
 
542 aa  58.9  3e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  27.11 
 
 
555 aa  57.4  7e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.55 
 
 
577 aa  55.8  2e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  23.03 
 
 
525 aa  56.6  2e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  21.35 
 
 
573 aa  55.5  3e-06  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  22.57 
 
 
638 aa  55.5  3e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  27.62 
 
 
531 aa  55.1  4e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  8.14089e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22 
 
 
584 aa  54.7  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.08 
 
 
589 aa  54.3  7e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.99 
 
 
584 aa  54.3  7e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1228  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.99 
 
 
584 aa  54.3  7e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.99 
 
 
584 aa  54.3  7e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.36 
 
 
562 aa  52.4  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1587  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22 
 
 
584 aa  52.8  2e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243588  normal  0.596865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.38 
 
 
587 aa  52.8  2e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  26.52 
 
 
530 aa  52.8  2e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.79 
 
 
591 aa  52  3e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  26.46 
 
 
542 aa  52  3e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.25 
 
 
592 aa  52.4  3e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  22.55 
 
 
534 aa  52  4e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.08 
 
 
588 aa  50.8  7e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.32 
 
 
595 aa  50.4  9e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.58 
 
 
583 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  23.02 
 
 
533 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  23.41 
 
 
533 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.99 
 
 
580 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.8 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.84 
 
 
588 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.76 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  26.42 
 
 
591 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.58 
 
 
583 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.72 
 
 
536 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  23.48 
 
 
532 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  27.86 
 
 
549 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20 
 
 
541 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.94 
 
 
576 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29790  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.71 
 
 
439 aa  48.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  27.5 
 
 
535 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.61 
 
 
590 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.69 
 
 
588 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>