More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2439 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 443 aa  887    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  78.28 
 
 		 441 aa  677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  77.14 
 
 		 456 aa  680    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  78.14 
 
 		 460 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  80.14 
 
 		 443 aa  716    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  67.53 
 
 		 438 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  64.45 
 
 		 442 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  68.94 
 
 		 447 aa  581  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  68.48 
 
 		 444 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  63.76 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  61.19 
 
 		 440 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  61.42 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  60.5 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  61.26 
 
 		 436 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  61.34 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  61.52 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  57.77 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  57.44 
 
 		 439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  61.06 
 
 		 437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  55.3 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  61.65 
 
 		 445 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  49.66 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  52.37 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  50.36 
 
 		 426 aa  431  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  50.34 
 
 		 442 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  50.97 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  50.83 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  46.92 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  46.24 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  44.18 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  45.77 
 
 		 436 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  44.65 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  44.13 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  42.59 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  42.86 
 
 		 437 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  43.76 
 
 		 439 aa  342  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  42.79 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  42.79 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  42.79 
 
 		 439 aa  332  9e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  42.45 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  39.54 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  41.83 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  41.34 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  41.82 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  41.34 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  40.57 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  41.8 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  38.07 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  39.06 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  40.14 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.8 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  37.94 
 
 		 430 aa  302  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  37.53 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  37.36 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  39.77 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  37.26 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.56 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  36.32 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  36.78 
 
 		 436 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  37.71 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  37.26 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  36.34 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  37.32 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  36.64 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  37.03 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  36 
 
 		 466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  36.67 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  38.52 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  37.95 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  35.33 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  38.3 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  36.94 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  34.5 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.26 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  35.99 
 
 		 407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  37.8 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  35.38 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  36.56 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  37.12 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  36.65 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  38.83 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  34.6 
 
 		 458 aa  263  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  35.39 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  31.12 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  37.16 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  33.18 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  32.95 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.4 
 
 		 443 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  31.4 
 
 		 443 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.16 
 
 		 443 aa  255  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  32.48 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  32.63 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  35.81 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  32.63 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  32.63 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  32.63 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  34.02 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  33.49 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>