55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2083 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  39.51 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  42.19 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  38.1 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  41.9 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  40.49 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  36.59 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  39.06 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  41.05 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  39.31 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  35.39 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  34.12 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  30.4 
 
 		 229 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  38.67 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  35.37 
 
 		 222 aa  94.7  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  35.54 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  32.95 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  33.5 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  32.85 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  30.3 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33.16 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  31.49 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  30.23 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  31.09 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  31.14 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  26.67 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28.3 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  33.33 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  29.38 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  32.52 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  29.53 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  31.76 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  28.22 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  29.55 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 373 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12641  hypothetical protein  29.06 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.536745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  27.57 
 
 		 266 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  29.29 
 
 		 280 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  29.01 
 
 		 283 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  28.28 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  33.11 
 
 		 357 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  27.14 
 
 		 380 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  31.36 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  24.58 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 361 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.93 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  25.53 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  28.46 
 
 		 401 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  27.69 
 
 		 212 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.75 
 
 		 294 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  24.14 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  27.69 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>