More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0141 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  55.17 
 
 
662 aa  653    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  56.79 
 
 
665 aa  694    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  68.6 
 
 
660 aa  832    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  61.5 
 
 
656 aa  698    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  58.82 
 
 
678 aa  676    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  56.95 
 
 
664 aa  694    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 
658 aa  1324    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  53.89 
 
 
653 aa  660    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  58.77 
 
 
657 aa  688    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  48.03 
 
 
659 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  48.01 
 
 
659 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  54.85 
 
 
540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  47.05 
 
 
651 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  40.93 
 
 
653 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  61.87 
 
 
700 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  61.87 
 
 
700 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  61.29 
 
 
731 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  61.6 
 
 
700 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
657 aa  433  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  42.88 
 
 
596 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  39.82 
 
 
652 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 
649 aa  404  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  36.63 
 
 
655 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  36.63 
 
 
655 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  34.69 
 
 
663 aa  378  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  56.03 
 
 
545 aa  363  4e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  56.03 
 
 
544 aa  363  8e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  36.55 
 
 
654 aa  361  3e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  50.41 
 
 
694 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  77.12 
 
 
236 aa  356  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  36.52 
 
 
604 aa  336  7.999999999999999e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  48.07 
 
 
654 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48.99 
 
 
651 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  45.84 
 
 
656 aa  300  5e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 
663 aa  244  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  42.69 
 
 
553 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 
621 aa  160  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  27.35 
 
 
627 aa  157  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 
633 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  27.42 
 
 
625 aa  150  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  29.41 
 
 
740 aa  141  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.89 
 
 
609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.13 
 
 
609 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258977  normal  0.0501221 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 
713 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 
372 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.55 
 
 
600 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 
708 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.88 
 
 
600 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0503971  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  24.39 
 
 
639 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 
702 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  45.51 
 
 
661 aa  125  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.79 
 
 
669 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.34 
 
 
659 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.01 
 
 
630 aa  124  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3105  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 
767 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.76 
 
 
658 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  47.53 
 
 
431 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
675 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  27.8 
 
 
626 aa  122  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.64 
 
 
615 aa  121  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371991  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.43 
 
 
682 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4046  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 
560 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
656 aa  122  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  27.32 
 
 
623 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  27.12 
 
 
778 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0151  methyl-accepting chemotaxis protein  31.15 
 
 
678 aa  121  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  28.69 
 
 
671 aa  121  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 
580 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 
616 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.02 
 
 
720 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 
580 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 
580 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 
580 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 
580 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 
580 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  44.58 
 
 
563 aa  120  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.15 
 
 
782 aa  120  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 
536 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 
599 aa  120  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  50 
 
 
656 aa  120  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 
548 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.85 
 
 
832 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.95 
 
 
677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0125911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.7 
 
 
631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 
622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
652 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
609 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0855945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 
592 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
530 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  58.49 
 
 
566 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 
548 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
626 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359668  normal  0.0114189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.94 
 
 
550 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 
673 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000001862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
608 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
563 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
579 aa  117  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>