More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2481 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  33.5 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  34.62 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  34.27 
 
 
210 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1652  HAD family hydrolase  35.65 
 
 
215 aa  102  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  31.9 
 
 
214 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  29.36 
 
 
214 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  32.39 
 
 
214 aa  98.2  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.58 
 
 
254 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28.37 
 
 
216 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  28.37 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.91 
 
 
217 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  27.52 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  28.85 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.52 
 
 
212 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  27.88 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  29.11 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
238 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.04 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  26.51 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.3 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1535  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.8 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.918107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.46 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.7 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.73 
 
 
219 aa  82  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  27.65 
 
 
239 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.48 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  25.36 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  34.59 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.15 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.46 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  25.68 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  28.19 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  26.99 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.91 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  32.61 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  26.24 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  23.72 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  25.32 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3398  phosphoglycolate phosphatase, putative  30.93 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  29.86 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  27.1 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  30.65 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  25.46 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  27.31 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.57 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  24.15 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.18 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  26.03 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  26.52 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  24.15 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  25.65 
 
 
242 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>