66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1302 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  31.16 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  30.37 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  27.7 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.33 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  48.98 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  22.07 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  19.13 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  20.24 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  28.17 
 
 		 258 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 195 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  19.13 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 199 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  24.1 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  20.6 
 
 		 203 aa  40.8  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  22.35 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>