More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3260 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  100 
 
 
623 aa  1259    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  66.72 
 
 
625 aa  798    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  67.47 
 
 
625 aa  800    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  49.28 
 
 
621 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  48.8 
 
 
621 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 
621 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
609 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  47.8 
 
 
604 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  50.08 
 
 
625 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  46.29 
 
 
611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  44.3 
 
 
611 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  45.23 
 
 
619 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
616 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  46.05 
 
 
603 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.95 
 
 
603 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 
626 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  43.69 
 
 
615 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 
618 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  43.18 
 
 
618 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  45.41 
 
 
623 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  43.68 
 
 
618 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  42.72 
 
 
615 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  42.18 
 
 
614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  41.76 
 
 
638 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  39.9 
 
 
613 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  41.06 
 
 
613 aa  429  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  39.77 
 
 
592 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.62 
 
 
600 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  38.19 
 
 
618 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  39.17 
 
 
606 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  38.4 
 
 
605 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
626 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  38.13 
 
 
608 aa  337  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  37.24 
 
 
619 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  35.59 
 
 
621 aa  332  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  33.51 
 
 
605 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  38.29 
 
 
626 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
608 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
616 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.08 
 
 
566 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  36.21 
 
 
595 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  32.66 
 
 
597 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  34.66 
 
 
633 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  30.15 
 
 
608 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.78 
 
 
633 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  33.5 
 
 
662 aa  287  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  32.59 
 
 
604 aa  287  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  33.61 
 
 
611 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.71 
 
 
587 aa  278  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  38.69 
 
 
599 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
616 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  29.85 
 
 
618 aa  263  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 
603 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  34.17 
 
 
627 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 
603 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 
596 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  37.72 
 
 
500 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 
596 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  35.47 
 
 
578 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  45.49 
 
 
631 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  32.23 
 
 
653 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.64 
 
 
594 aa  246  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
604 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  31.94 
 
 
611 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  28.66 
 
 
591 aa  243  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  31.98 
 
 
673 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  33.08 
 
 
647 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.92 
 
 
634 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  45.85 
 
 
626 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  33.1 
 
 
623 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  37.64 
 
 
590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  27.99 
 
 
624 aa  234  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  32.56 
 
 
619 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.28 
 
 
582 aa  233  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 
592 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.41 
 
 
567 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.87 
 
 
614 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  43.12 
 
 
578 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  28.83 
 
 
593 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  45.12 
 
 
746 aa  230  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  38.53 
 
 
575 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.33 
 
 
585 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.1 
 
 
609 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.42 
 
 
641 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  28.87 
 
 
606 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  36.1 
 
 
610 aa  229  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.81 
 
 
595 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  35.92 
 
 
618 aa  229  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.12 
 
 
595 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.43 
 
 
575 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
582 aa  228  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  33.33 
 
 
705 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.42 
 
 
580 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  42.39 
 
 
606 aa  227  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.18 
 
 
603 aa  226  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.92 
 
 
618 aa  226  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  48.24 
 
 
594 aa  226  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  32.14 
 
 
611 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  42.16 
 
 
598 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.48 
 
 
639 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>