More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2353 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 157 aa  312  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  71.97 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 		 155 aa  212  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  48.08 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  45.45 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  43.31 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  53.95 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  41.83 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  48.57 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  40.26 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  42.04 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>