More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0756 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  808    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  76.84 
 
 
393 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  69.39 
 
 
393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  68.19 
 
 
393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  69.13 
 
 
393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  61.73 
 
 
394 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  62.24 
 
 
394 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  40.87 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  40.62 
 
 
395 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  42.23 
 
 
396 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  41.86 
 
 
391 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  43.41 
 
 
392 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  43.04 
 
 
397 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  41.07 
 
 
415 aa  292  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  41.22 
 
 
394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  38.93 
 
 
418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  40.2 
 
 
394 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  43.41 
 
 
400 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  40.72 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  37.82 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  39.42 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  40.36 
 
 
407 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  39.74 
 
 
394 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  40.1 
 
 
407 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  39.58 
 
 
391 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  41.8 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  37.44 
 
 
398 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  39.06 
 
 
391 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  39.95 
 
 
391 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  39.33 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  38.13 
 
 
413 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  38.73 
 
 
416 aa  265  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  38.6 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  38.6 
 
 
404 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  40.26 
 
 
389 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  35.7 
 
 
388 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  38.79 
 
 
391 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  37.72 
 
 
398 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.38 
 
 
391 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  40.64 
 
 
389 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  38.97 
 
 
397 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  38.35 
 
 
404 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  38.1 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  39.63 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  41.84 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  37.99 
 
 
396 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  39.2 
 
 
396 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  37.88 
 
 
400 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  41.01 
 
 
388 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  40.56 
 
 
403 aa  259  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  41.25 
 
 
416 aa  258  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  38.35 
 
 
404 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  38.35 
 
 
404 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  38.35 
 
 
404 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  38.07 
 
 
398 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  39.5 
 
 
408 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  37.47 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  37.47 
 
 
403 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  37.47 
 
 
403 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  38.21 
 
 
398 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  37.47 
 
 
403 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  37.47 
 
 
403 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.1 
 
 
404 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  37.31 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  39.69 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  39.69 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  39.69 
 
 
400 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  38.01 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  38.68 
 
 
397 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  38.74 
 
 
394 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  37.66 
 
 
396 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 
396 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 
396 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 
396 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  38.21 
 
 
399 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  37.66 
 
 
396 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  37.95 
 
 
398 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  37.92 
 
 
396 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  37.17 
 
 
422 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  37.21 
 
 
396 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  38.93 
 
 
397 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  38.64 
 
 
400 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  36.18 
 
 
394 aa  249  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  39.22 
 
 
367 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  39.22 
 
 
367 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  37.95 
 
 
398 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  36.9 
 
 
425 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  37.95 
 
 
398 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  36.6 
 
 
423 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.66 
 
 
397 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  39.95 
 
 
398 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  37.97 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  37.66 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  36.96 
 
 
409 aa  246  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>