276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6144 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  44.12 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  45.28 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  43.93 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  47.5 
 
 		 293 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  38.78 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  38.05 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.9 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  35.29 
 
 		 336 aa  92  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.76 
 
 		 335 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 351 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  31.61 
 
 		 342 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  30.6 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  35.55 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  25.48 
 
 		 317 aa  85.1  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  25.84 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  35.33 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.64 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  28.73 
 
 		 329 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  24.82 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.41 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.15 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.5 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.94 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  35.76 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  25.94 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.17 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  35.93 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 362 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  27.07 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  32.18 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.68 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 360 aa  75.5  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  25.87 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  28.62 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.37 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.8 
 
 		 355 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.87 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.85 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  31.17 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  26.81 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  23.37 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.26 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.23 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.98 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  27.32 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.46 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.17 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.82 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  28.31 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  27.34 
 
 		 327 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  27.8 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  34.91 
 
 		 313 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  33.13 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  35.67 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  36.21 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.39 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  39.34 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  36.88 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  33.92 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.54 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  32.54 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.93 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  33.13 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.59 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  31.79 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  33.13 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.95 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  26.47 
 
 		 382 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  32.96 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  27.41 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  34.83 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  28.66 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  35.62 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  30.5 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.67 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  25.99 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  31.87 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  34.36 
 
 		 404 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  37.01 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  33.53 
 
 		 338 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  34.36 
 
 		 404 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  34.36 
 
 		 404 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>