More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4664 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.24 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.46 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.57 
 
 		 299 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.41 
 
 		 297 aa  358  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.92 
 
 		 299 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.92 
 
 		 299 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.23 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.23 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.12 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.25 
 
 		 301 aa  343  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  58.86 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.69 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  52.03 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.78 
 
 		 201 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.66 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.8 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  27.8 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  27.8 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  29.69 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  29.26 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  28.86 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  33.8 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  26.82 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 267 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 348 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 348 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 279 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 277 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  33.92 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 277 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  28.11 
 
 		 277 aa  96.3  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 279 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 268 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.39 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>