More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0848 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
322 aa  627  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000000126936  hitchhiker  0.00000000866182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  74.13 
 
 
317 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  72.5 
 
 
317 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5972  NADH dehydrogenase (quinone)  65.3 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723565  normal  0.842062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4385  NADH dehydrogenase (quinone)  75.5 
 
 
322 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0464  NADH dehydrogenase (quinone)  66.04 
 
 
320 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0393  NADH dehydrogenase (quinone)  66.03 
 
 
320 aa  362  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.14 
 
 
337 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  40.51 
 
 
348 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  42.22 
 
 
349 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  41.9 
 
 
349 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  43.54 
 
 
333 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.74 
 
 
349 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  41.48 
 
 
353 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.63 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.63 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.81 
 
 
322 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  42.52 
 
 
333 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  43.38 
 
 
328 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  40.51 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.94 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  40.51 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.49 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  40.82 
 
 
333 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  39.14 
 
 
433 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  40 
 
 
462 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  37.34 
 
 
349 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  43 
 
 
340 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43 
 
 
340 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.67 
 
 
344 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  40.76 
 
 
349 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  44.15 
 
 
329 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  40.74 
 
 
430 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 
318 aa  222  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  41.96 
 
 
352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  40.48 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  40.91 
 
 
441 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  39.21 
 
 
451 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  40.98 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.85 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.67 
 
 
331 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  39.08 
 
 
357 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  40.44 
 
 
438 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 
472 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  39.51 
 
 
440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  38.99 
 
 
410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  38.64 
 
 
360 aa  215  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  39.12 
 
 
372 aa  215  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  40.48 
 
 
341 aa  215  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  40.67 
 
 
416 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  40.67 
 
 
416 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  40.13 
 
 
447 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  40.67 
 
 
416 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  39.42 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.89 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  39.41 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.71 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.63 
 
 
343 aa  212  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  38.56 
 
 
411 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.58 
 
 
366 aa  211  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  37.03 
 
 
372 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  38.36 
 
 
364 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  39.02 
 
 
354 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1285  NADH dehydrogenase (quinone)  37.76 
 
 
455 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.853788  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
390 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  37.66 
 
 
372 aa  210  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.38 
 
 
329 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  37.66 
 
 
372 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  39.56 
 
 
372 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.83 
 
 
347 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  39.87 
 
 
384 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  40.71 
 
 
372 aa  209  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  37.9 
 
 
372 aa  208  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  39.56 
 
 
372 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.82 
 
 
359 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  34.22 
 
 
365 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.3 
 
 
372 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  37.79 
 
 
358 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.54 
 
 
337 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  37.94 
 
 
449 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
338 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  43.73 
 
 
351 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  37.01 
 
 
361 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  42.21 
 
 
354 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  41.36 
 
 
323 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  40.44 
 
 
316 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.02 
 
 
340 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  38.56 
 
 
358 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  38.36 
 
 
354 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>