274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3116 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  64.79 
 
 		 267 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  62.36 
 
 		 263 aa  349  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  63.81 
 
 		 270 aa  348  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  63.81 
 
 		 270 aa  347  8e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  58.94 
 
 		 263 aa  325  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  58.17 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.31 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.25 
 
 		 300 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.73 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.87 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  44.83 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.13 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.13 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.22 
 
 		 262 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.29 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.97 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.26 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.15 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.06 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.54 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.54 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.06 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  41.98 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.46 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.3 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.3 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.11 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.59 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.68 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.85 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.77 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  41.67 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.93 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.75 
 
 		 281 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  40.15 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.2 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  40.23 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.31 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.59 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.4 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  40.84 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  40.6 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.38 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  41.2 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.91 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.64 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.26 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.7 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  41.82 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.37 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.18 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.78 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.15 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.47 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  36.88 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.61 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.43 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.32 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  38.6 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  35.66 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.45 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.6 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.7 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.38 
 
 		 277 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.46 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.78 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  37.56 
 
 		 210 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  35.29 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.46 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  30.29 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.36 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.77 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.4 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  27.68 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  29.66 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  27.34 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  27.34 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  27.34 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  29.31 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  27.34 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.59 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  28.97 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.96 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  27.72 
 
 		 297 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.28 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  29.15 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.42 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.96 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.99 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.89 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  28.21 
 
 		 278 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.11 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.15 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.2 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.05 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.21 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.95 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  24.1 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.434232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>