More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0474 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  48.15 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  36.4 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  33.71 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.94 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.94 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.94 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.94 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.53 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.61 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  25.85 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  25.51 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.2 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.2 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  25.2 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.2 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.2 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.2 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.2 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  21.46 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.29 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  25.96 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.72 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.2 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.92 
 
 		 310 aa  85.9  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  26.61 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.9 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.92 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.9 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.92 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.9 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.51 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.6 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.21 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  23.73 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 1201 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  23.13 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  18.99 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  23.88 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  25.96 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  24.38 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.9 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  31.07 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  36.19 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  25.31 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.34 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  21.72 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>