More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1770 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  87.37 
 
 
396 aa  726    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  100 
 
 
396 aa  816    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  79.29 
 
 
396 aa  664    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  75.25 
 
 
396 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  71.21 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0291  cysteine desulfurase  71.47 
 
 
393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0238  putative cysteine desulfurase  71.47 
 
 
393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  70.18 
 
 
392 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0265  cysteine desulfurase, putative  70.95 
 
 
393 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  64.51 
 
 
404 aa  526  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  48.18 
 
 
402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  47.24 
 
 
396 aa  348  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  46.98 
 
 
404 aa  342  9e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.68 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 
389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 
400 aa  340  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 
389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.62 
 
 
389 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  45.57 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  44.36 
 
 
391 aa  332  9e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.14 
 
 
400 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.01 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.17 
 
 
382 aa  328  8e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  46.07 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  44.36 
 
 
394 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.31 
 
 
404 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  43 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  43.49 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  44.39 
 
 
391 aa  325  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.94 
 
 
398 aa  324  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  44.88 
 
 
407 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.01 
 
 
394 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
401 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
402 aa  323  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
401 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  43.08 
 
 
391 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.41 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.98 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  43.41 
 
 
403 aa  318  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.13 
 
 
384 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  42.5 
 
 
402 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  44.09 
 
 
401 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
384 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.36 
 
 
398 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  42.36 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.04 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.04 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.15 
 
 
398 aa  311  9e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.38 
 
 
398 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  43.15 
 
 
405 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.49 
 
 
396 aa  309  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.99 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.06 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.78 
 
 
417 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.01 
 
 
388 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  45.03 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.04 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  41.45 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  43.57 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.19 
 
 
400 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.31 
 
 
400 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.2 
 
 
392 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.33 
 
 
392 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.32 
 
 
393 aa  301  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  44.3 
 
 
400 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 
393 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  43.08 
 
 
388 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
387 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40 
 
 
404 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  43.38 
 
 
387 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.3 
 
 
396 aa  293  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.45 
 
 
402 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  41.34 
 
 
436 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  41.34 
 
 
436 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  40.83 
 
 
405 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.09 
 
 
406 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.6 
 
 
1143 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.42 
 
 
389 aa  291  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  43.46 
 
 
410 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.34 
 
 
405 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.07 
 
 
409 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  42.29 
 
 
1139 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.34 
 
 
405 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  41.86 
 
 
405 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  41.09 
 
 
403 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  43.72 
 
 
407 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  42.27 
 
 
394 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
405 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  42.93 
 
 
407 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.57 
 
 
403 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  41.21 
 
 
390 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  40.57 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  40.1 
 
 
403 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.63 
 
 
388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>